Questions? korbinian.schneeberger@tuebingen.mpg.de ############################################################## release 2009_12_27 initial version ############################################################## release 2010_02_23 fixed TAIR8 to TAIR9 bug in files with multiple position identifiers. ############################################################## release 2010_03_22 Fixed TAIR9 conversion bug in insertion.txt files ############################################################## release 2010_03_25 Introduce unmasked TAIR8 reference sequence back in the genome matrix rather than the masked version used for mapping ############################################################## release 2010_05_12 Fixed missing bases in TAIR8 genome matrix ############################################################## release 2010_05_13 Split SV deletions in two sets, complex and simple ############################################################## release 2010_05_18 Fixed wrong SV_deletion files in TAIR9 Fixed empty small insertion files in TAIR9 Added bulk download ############################################################## release 2010_05_19 Renamed Pre-6 to Pra-6 ############################################################## release 2010_07_01 added Nordborg 215k subsampling of genome matrix ############################################################## release 2010_10_18 Updated genome matrix for repetitive positions Removed chromosomes 6 and 7 from genome matrix ############################################################## release 2010_11_16 Fixed compression errors for TAIR9 versions of working_reference.txt.gz for Kastel-1 and Koch-1 ############################################################## release 2011_01_28 Added TAIR10 data sets (which are in fact copies of the TAIR9 versions as positions haven't changed) ############################################################## release 2011_05_31 Added short reads for download ############################################################## release 2011_08_23 Corrected strains/column mapping for README_Genomematrix ############################################################## release 2012_03_13 Updated genome matrix for missing reference insertions introduced in TAIR9/TAIR10. The matrix has now a canonical length of 119146348 (before, it was 119146134, where missing 214 positions from 205 insertions).